En ketogen diet eller modifierad ketogen diet (Atkins-dieten) kan övervägas för behandling av svår epilepsi om man inte får tillräcklig terapirespons med epilepsiläkemedel, om man har många biverkningar och om kirurgisk behandling inte är möjlig. Att genomföra en diet är tidskrävande och kräver ett nära samarbete med en näringsterapeut som har erfarenhet av kostbehandling.
Den viktigaste behandlingsbara metabola epilepsin som hittills identifierats är Glukostransportprotein typ 1-bristsyndrom (Glucose transporter type 1 deficiency syndrome (GLUT1-DS)), som är förknippad med en fördröjning i utvecklingen. Syndromet orsakas av en mutation i SLC2A1-genen. Enbart epilepsiläkemedel hjälper inte patienten utan en ketogen diet används för att behandla syndromet.