Epilepsiaa voivat aiheuttaa kaikki vauriot tai sairaudet, jotka häiritsevät aivojen rakennetta tai toimintaa. Kaikilla potilailla ei löydy selvää yksittäistä syytä epilepsialle. Henkilön epilepsian syyn selvittäminen on tärkeä osa diagnostiikkaa, sillä osaa epilepsioista voidaan tehokkaimmin hoitaa hoitamalla aktiivisesti epilepsian taustalla olevaa aivosairautta.
Epilepsioita aiheuttavat syyt jaetaan nykyisin
rakenteellisiin,
geneettisiin,
infektioperäisiin,
aineenvaihdunnallisiin,
immuunivälitteisiin sekä
toistaiseksi tuntemattomiin.