Isotretinoiinihoito voidaan aloittaa myös silloin, kun oikein toteutetut muut hoidot ovat osoittautuneet tehottomiksi tai jos akne on uusinut toistuvan asianmukaisen hoidon jälkeen.
Isotretinoiinihoidon toteutus ja seuranta kuuluvat ihotautilääkärille. Hoidon aikana potilaalle tehdään laboratoriotutkimuksia mahdollisten haittavaikutusten löytämiseksi.
Joissakin vaikeissa aknemuodoissa (acne fulminans, acne conglobata) joudutaan isotretinoiinin lisäksi käyttämään muita suun kautta otettavia lääkkeitä. Tällaisten potilaiden hoito ja seuranta tulee toteuttaa ihotautilääkärin valvomana erikoissairaanhoidossa.