Nivelkivun tavallisimmat syyt ovat vammat, huonot työasennot, virusinfektiot, erilaiset aineenvaihduntasairaudet, nivelrikko ja erilaiset reumaattiset tulehdussairaudet.
Huolellisen taustan kartoittamisen ja kliinisen tutkimuksen jälkeen voidaan tutkia nivelkipujen syyn selvittämiseksi esimerkiksi veren tulehduskokeet (lasko ja CRP). Borrelia vasta-aineita ei tule määrittää ilman kliinistä epäilyä.