Crohnin tautia sairastavista 25 prosenttia tarvitsee leikkaushoitoa viiden vuoden kuluessa diagnoosista. Noin puolet joudutaan leikkamaan 20 vuoden kuluessa diagnoosista. Leikatuista noin puolet joutuu uusintaleikkaukseen. Jotkut käyvät läpi useita leikkauksia, ja uusintaleikkauksen riski kasvaa jokaisella leikkauskerralla.
Crohnin taudin leikkaukseen päädytään, jos potilaalla on
- vaikea tulehdus, jota ei saada lääkkeillä rauhoittumaan
- ahtauma tai tukos suolessa
- märkäpaise tai fisteleitä
- vaikea verenvuoto tai suolen puhkeaminen tai raju verenvuoto
- todettu syöpäriski
- perianaaliseen Crohnin tautiiin liittyviä vaikeahoitoisia fisteleitä ja paiseita.
Edellä mainittujen lisäksi myös jatkuva anemia, kipu ja aliravitsemus ovat leikkausaiheita.