Hoidon seurannan tavoitteena on varmistaa, että sairaus pysyy remissiossa eli oireettomana ja jos sairaus aktivoituu, siihen saadaan apua mahdollisimman nopeasti. Ylläpitolääkityksen säännöllinen käyttö ja hoito-ohjeiden seuraaminen ovat perusedellytys remissiossa pysymiseen ja siihen palaamiseen. Seurantaan kuuluu laboratoriokokeita sekä tähystyksiä tai muita kuvantamistutkimuksia.
Hoito ja seuranta järjestetään sairaaloiden gastroenterologian vastaanotoilla, sisätautivastaanotoilla, lasten vastaanotoilla, terveyskeskuksissa, työterveyshuollossa tai lääkäriasemilla.
Rauhallisessa vaiheessa olevan taudin pitkäaikaisseuranta voidaan toteuttaa perusterveydenhuollossa.