Av patienter med Crohns sjukdom behöver ungefär hälften kirurgisk behandling inom tio år efter diagnosen. Cirka 35 procent måste genomgå en ny operation under de följande tio åren. Orsaker som leder till operation vid Crohns sjukdom
en förträngning eller ett stopp i tarmen
en varböld eller fistlar
en tarmperforation eller svår blödning
cancer eller förstadium till cancer relaterad till Crohns sjukdom
svårbehandlade fistlar och bölder som hör till perianal Crohns sjukdom.