I samband med behandlingen avlägsnas allt hår mellan skinkorna och från huden runt såret. Vid behov avlägsnas enskilda hårstrån med en pincett. På så sätt är det lättare att fästa och ta loss sårförbanden. Det förhindrar också att hår kommer in i såret, vilket kan störa sårläkningen.
Om pilonidalsinus har kommit tillbaka eller om man har särskilt mycket hår mellan skinkorna kan laserbehandling rekommenderas för att avlägsna hår från området. Laserbehandling av hårväxt har konstaterats förebygga återfall bättre än andra hårborttagningsmetoder eller bättre än att man inte alls avlägsnar hår från området.