Immunoglobuliinihoito
Vakavia ja oireisia vasta-ainepuutoksia hoidetaan immunoglobuliinikorvaushoidolla. Se toteutetaan joko ihonalaisesti kotona tai suonensisäisesti sairaalassa määrävälein.
Kantasolunsiirto ja muu hoito
Vaikeat kombinoidut immuunipuutokset (yleensä lapsia) hoidetaan allogeenisellä kantasolunsiirrolla.
Geeninsiirto on uusi, pääosin vielä tutkimuksellinen, hoitomuoto osassa näistä taudeista.
Osa potilaista tarvitsee pitkäkestoista antibiootti- tai sienilääkehoitoa infektion ehkäisemiseksi.
Osalla immuunipuutospotilaista elävät rokotteet ovat vasta-aiheisia. Toisaalta esimerkiksi komplementtipuutoksissa rokotteet ovat oleellisia potilaan suojaamisessa. Rokotuksista kannattaa kysyä potilaan immuunipuutosta hoitavalta lääkäriltä.