Lasten elinsiirtojen syynä on useimmiten synnynnäinen sairaus, joka hoidoista huolimatta johtaa elimen vaikeaan vajaatoimintaan. Yleisimmät lasten elinsiirrot ovat munuais-, maksa- ja sydänsiirrot.
Elinsiirtoon johtavat vakavat munuais-, maksa- ja sydänsairaudet vaikuttavat usein suun terveyteen jo ennen elinsiirtoa. Myös elinsiirron jälkeen voidaan nähdä vaikutuksia suun terveydessä. Elinikäinen hyljinnänestolääkitys voi altistaa suun infektioille. Osa lääkkeistä voi aiheuttaa muitakin suun terveyden haasteita, kuten ikenien liikakasvua. Ikenen liikakasvu voi puolestaan hankaloittaa hampaiden puhkeamista ja hampaiden puhtaana pitoa.