De vanligaste transplantationerna på barn är njur- och levertransplantationer. Orsaken till en njurtransplantation är oftast CNF, en sjukdom där barnet förlorar mycket protein i urinen, medfödda missbildningar i urinvägarna eller andra medfödda sjukdomar. En medfödd gallvägsatresi, dvs. avsaknad av gallgångar, är den vanligaste orsaken till levertransplantation hos barn.
Barns organtransplantationsverksamheten i vårt land är centraliserad till HUS. På Nya barnsjukhuset i Helsingfors utförs årligen 20–30 organtransplantationer på barn.