Endometrioosia voi olla
virtsarakon seinämässä
suolistossa (paksusuolen, peräsuolen, ohutsuolen tai umpilisäkkeen pinnalla tai seinämässä)
palleassa
kohdussa
emättimen pohjukassa
emättimen ja peräsuolen välisessä seinämässä (niin sanottu rektovaginaalisen septumin endometrioosi)
vatsanpeitteiden leikkausarvissa.
Endometrioosi jaetaan kolmeen pääryhmään esiintymispaikkansa mukaisesti: