NKH klassificeras i två grupper baserat på i vilken ålder symtomen börjar uppträda: tidig NKH hos nyfödda och NKH hos spädbarn, som uppträder senare.
De flesta finländska NKH-patienter diagnostiseras med den tidiga sjukdomsformen, som vanligtvis uppträder under de första dagarna i livet som progressiv muskelslapphet och kramper som leder till andningsstörningar, koma och ofta död. Om ett nyfött barn med tidig NKH överlever leder ovanstående symtom vanligtvis till en djup utvecklingsstörning och svår epilepsi.
Senare i spädbarnsåldern är de typiska symtomen på NKH låg muskelspänst, olika grader av utvecklingsförsening, hyperaktivitet, tvångsrörelser och lindrigare krampanfall.
Det finns också atypiska former av sjukdomen med en mer varierande symtombild och en debutålder som kan variera från tidig barndom till vuxen ålder.