Onnistuneen kolonoskopian edellytyksenä on suolen täydellinen tyhjentäminen, mikä vaatii aikaa. Tarkemmat potilaskohtaiset ohjeet ja suolen tyhjennysohjeet saa hoitavasta yksiköstä.

Paksunsuolen tähystystutkimus pyritään tekemään kivuttomasti, ja sen yhteydessä annetaan tarvittaessa rauhoittavaa lääkettä ja/tai kipulääkitystä suonensisäisesti. Mahdollisen lääkityksen vuoksi ei ole suositeltavaa tulla tähystykseen omalla autolla. Tarvittaessa tutkimus voidaan tehdä myös nukutuksessa.

Paksusuolen tähystyksessä lääkäri tutkii taipuisalla tähystimellä koko paksusuolen peräaukosta ohutsuoleen saakka. Tähystystutkimus mahdollistaa koko paksusuolen ja ohutsuolen loppuosan tutkimisen sekä koepalojen ottamisen. Tähystyksen yhteydessä voidaan tehdä toimenpiteitä   kuten poistaa polyyppejä eli limakalvokasvaimia. Polyypit ovat usein mahasuolikanavan pahanlaatuisten kasvainten esiasteita. Polyyppien poistolla ehkäistään niiden muuttuminen pahanlaatuisiksi kasvaimiksi.

Tähystystutkimus kestää noin tunnin, mutta käyntiä varten on hyvä varata aikaa 1 – 2 tuntia.

Tähystyksen jälkeen voi syödä ja juoda sekä ottaa lääkkeet normaalisti. Jos rauhoittavaa tai kipulääkitystä käytetään, täytyy varautua jäämään poliklinikalle 1 – 2 tunniksi tutkimuksen jälkeen. Potilaalla tulee olla saattaja kotimatkaa varten, ja autolla ajo on kielletty tutkimuspäivänä.