Enteroskopian avulla on mahdollista, ainakin teoriassa, tutkia koko ohutsuoli, ottaa koepaloja suolen limakalvolta ja tehdä tarvittavia muita toimenpiteitä, kuten poistaa polyyppeja.

Enteroskopian tavallisin aihe on epäselvä ruoansulatuskanavan verenvuoto. Muita tutkimuksen aiheita ovat näytteenotto kapselikameratutkimuksessa tai muussa ohutsuolen kuvantamisessa todetuista muutoksista. Edeltävänä tutkimuksena on useimmiten tehty ohutsuolen kapselikameratutkimus.

Enteroskopia voidaan tehdä kaksoispallotekniikalla tai yksöispallotekniikalla. Tutkimus kestää useimmiten 1 – 2 tuntia. Sen aikana potilas tarvitsee yleensä rauhoittavan lääkityksen. Tutkimus tehdään joko yläkautta kuten mahan tähystyksessä tai alakautta kuten paksusuolen tähystyksessä.​