Lääkehoito ei ole parantavaa, mutta se rauhoittaa limakalvon tulehdusta ja vähentää oireita. Useimmiten tarvitaan pitkäaikaista ylläpitolääkitystä. Tulehduksen rauhoituttua ylläpitolääkityksellä pyritään saavuttamaan mahdollisimman pitkiä oireettomia vaiheita. Ottamalla lääkkeet säännöllisesti voidaan välttää taudinkulkuun kuuluvia pahenemisvaiheita. Pahenemisvaiheiden aikana lääkitystä tulee tehostaa.
Sopivan lääkehoidon löytämiseksi saattaa joutua kokeilemaan useita eri lääkevaihtoehtoja. Lääkehoitoon saa ohjausta hoitavalta lääkäriltä ja hoitajalta. Lääkehoidon tehoa arvioidaan seuraamalla oireiden määrää ja/tai tekemällä laboratoriokokeita, tähystyksiä tai muita kuvantamistutkimuksia.
Lääkkeistä saa erityiskorvauksen lääkärin kirjoittamalla B-lausunnolla.