Keskustele sinua hoitavan lääkärisi kanssa mahdollisista lääketauoista. Monilla tavallisilla esimerkiksi sydän- ja verenkiertosairauksiin käytetyillä lääkkeillä on jonkin verran vaikutusta ruokatorven liiketoimintaan, mutta niiden tauottaminen ei yleensä ole tarpeen. Varsinaiset ruokatorven toiminnan hoitolääkkeet eli prokineetit tulee jättää tauolle kaksi vuorokautta ennen tutkimusta ja sama koskee pääsääntöisesti myös hermostoon voimakkaasti vaikuttavia ns. kolmiolääkkeitä.
Ennen tutkimusta ei pidä nauttia alkoholia puoleentoista vuorokauteen. Yritä levätä tutkimusta edeltävä yö hyvin. Paastoa ennen tutkimusta vähintään 5 tuntia, jottei mahan sisältö tuki tutkimusletkua eikä myöskään pääse tutkimuksen aikana nousemaan hengitysteihin. Tarvittavat lääkkeet (muut kuin ruokatorven toimintaan määrätyt) voit kuitenkin ottaa pienen vesitilkan kera. Mikäli tutkimus jännittää, voit ottaa mukaan tukihenkilön.