​Sappirakkosyövän yleisin riskitekijä on sappikivitauti ja noin 90 prosenttia sappirakon syövistä kehittyy sappirakkoon, jossa on sappikiviä.

Sappiteitä ahtauttava krooninen sappitietulehdus (PSC) on melko harvinainen sappiteiden sairaus, johon liittyy selkeästi kohonnut sappitiesyöpien riski. Myös haavainen paksusuolentulehdus (colitis ulcerosa) lisää jonkin verran sappitiesyöpien riskiä. Suurimmassa osassa sappitiehyen syöpiä ei kuitenkaan voida osoittaa erityistä syytä.