Bieffekternas förekomst och svårighetsgrad är individuella. Den dagliga isotretinoindosen kan vid behov minskas enligt en hudläkares anvisningar.
En av de allvarligaste bieffekterna är att isotretinoin orsakar fosterskador. På grund av detta ska kvinnor i fertil ålder använda ett effektivt preventivmedel minst 5 veckor innan isotretinoinbehandlingen inleds, under hela isotretinoinbehandlingen och ännu 5 veckor efter avslutad isotretinoinbehandling.
Lever- och fettvärden undersöks innan behandlingen inleds, efter den första behandlingsmånaden samt regelbundet under behandlingen med minst tre månaders intervaller, såvida det inte finns behov av intensivare uppföljning.