Behandling av medfödda hjärtfel kräver specialkompetens både inom diagnostisering och behandling. Vårdpersonalen måste känna till särdragen i fysiologi och hemodynamik.
Ett EKG, dvs. elektrokardiogram, är ett av de grundläggande undersökningarna för hjärtsjukdomar. Vid behov utförs EKG som en långtidsregistrering. Det vanligaste belastningsprovet är belastnings-EKG. Ultraljuds- och magnetundersökningar av hjärtat å sin sida är de vanligaste bilddiagnostiska undersökningarna som används för att undersöka och behandla hjärtsjukdomar.
Särskilt vid behandling av komplicerade hjärtfel är det viktigt att kombinera kateteråtgärder och kirurgisk behandling, vilket gör att det behövs färre operationer under patientens livstid. De kirurgiska och perkutana (kateterbaserade) teknikerna utvecklas ständigt.