Harvinaisempia munasarjan ei-epiteliaalisia kasvaimia ovat itusolu- ja sukupienakasvaimet, joiden lähtökohtana ovat joko sikiökautiset alkusukusolut tai munasarjan sisäosan kudos. Näistä kasvaimista osa on hyvänlaatuisia ja osa pahanlaatuisia. Munasarjatuumoreista itusoluperäisiä on noin 20 prosenttia, mutta munasarjasyövästä se käsittää vain 1 - 3 prosenttia. Samoin sukupienakasvaimet kattavat munasarjasyövästä vain 2 prosenttia.