Tulehdusten riski on suurimmillaan heti munuaissiirron jälkeen, kun lääkeannokset ovat suuria. Hyljinnänestolääkkeillä on myös monia muita haittavaikutuksia, mutta niiden ilmaantuminen on yksilöllistä. Ongelmista kannattaa aina keskustella hoitohenkilökunnan kanssa. Mikäli haittavaikutukset ovat hyvin häiritseviä ja vaikeita, voidaan harkita lääkeannoksien pienentämistä tai toiseen paremmin sopivaan valmisteeseen siirtymistä. Lääkemuutoksiin liittyy kuitenkin aina riski hyljinnästä ja munuaissiirteen toiminnan heikentymisestä, joten hyljintälääkitystä ei saa koskaan lopettaa omin päin tai lääkkeiden annostusta muuttaa ilman hoitavan lääkärin lupaa.