Magnetundersökning kallas också för MRI (magnetic resonance imaging). I magnetundersökningen används inte röntgenstrålar, utan metoden baserar sig på att kroppens väteatomer reagerar på anordningens magnetfält. Utöver hjärnan kan magnetundersökning användas för att ta bilder av många andra organ och utreda sjukdomar. Metoden passar barn i alla åldrar, också spädbarn.
Magnetundersökningen tar cirka 15–45 minuter. Man måste ligga helt stilla under en magnetundersökning, så små barn sövs ned under undersökningen. Föräldrarna kan vara med i undersökningsrummet tills barnet somnar.
Magnetundersökningsanordningen har en magnettunnel som är cirka 60–70 cm i diameter. Tunneln är ventilerad, belyst och öppen i båda ändarna. Kameran har tidvis ganska höga ljud, så om den undersökta är vaken, ges hen hörselskydd i vilka man kan lyssna på radio eller annan musik. Personen som undersöks får också en larmknapp i handen för att vid behov få kontakt med skötaren.