De vanligaste transplantationerna på barn är njur- och levertransplantationer. Orsaken till en njurtransplantation är oftast en medfödd svår protein i urinen (CNF), medfödda missbildningar i urinvägarna eller andra medfödda sjukdomar. En medfödd gallvägsatresi (BA), dvs. avsaknad av gallgångar, är den vanligaste orsaken till levertransplantation hos barn. På Nya barnsjukhuset utförs årligen 20–30 organtransplantationer på barn.