​​Potilaita tulee Taysiin lastenkirurgiseen hoitoon sekä päivystyksellisesti että suunniteltuihin toimenpiteisiin. Lastenkirurgi päivystää Taysissa kaikkina päivinä ympäri vuorokauden.

Taysissa lastenkirurgialla hoidettavia ongelmia tai sairauksia ovat muun muassa:

• vastasyntyneiden suoliston rakennepoikkeavuudet
• synnynnäiset virtsa- ja sukupuolielinten poikkeavuudet
• raajojen ja nivelten poikkeavuudet
• selkäongelmat
• raajojen murtumat
• nivelvammat
• pehmytosien syövät
• tulehdukselliset suolistosairaudet
• vaikeat virtsaamishäiriöt.

Lastenkirurgiset potilaat ovat 0–18-vuotiaita. Suurin osa heistä hoidetaan lasten ja nuorten kirurgisella osastolla, mutta esimerkiksi neurokirurgiset potilaat menevät jatkohoitoon lasten teho- ja tarkkailuosastolle. Kaikki osastoseurantaa vaativat kirurgisen toimenpiteet lapsille ja nuorille tehdään Tays Keskussairaalan leikkausosastoilla.

Päiväkirurgisia toimenpiteitä tehdään Tays Keskussairaalan päiväkirurgian osastolla ja Tays Valkeakosken sairaalassa. Päiväkirurgisesti hoidettavia tilanteita ovat esimerkiksi laskeutumattomat kivekset, esinahan kireys, nivustyrät, pattien poistot ja polven tähystykset.

Vastasyntyneiden leikkaukset ja hoito toteutetaan pääasiassa vastasyntyneiden teho-osastolla. Tays vastaa koko erityisvastuualueen neonataalikirurgiasta.
Taysissa lasten ja nuorten gastrokirurgian erityisenä painopistealueena on tulehduksellisten suolistosairauksien hoito. Ruuansulatuskanavan tähystyksiä ja niihin liittyviä toimenpiteitä tehdään vuosittain noin 150. Vatsa- ja thoraxontelon syöpäkirurgisia toimenpiteitä tehdään useita vuodessa yhteistyössä lasten hematologian ja onkologian yksikön kanssa.

Lasten ja nuorten ortopedia ja traumatologia Taysissa pitää sisällään perus- ja vaativan tason murtumahoidon ja kaikki lasten ja nuorten ortopediset osa-alueet. Erityisosaamisalueena on selkäkirurgia. Ortopedinen syöpäkirurgia hoidetaan yhteistyössä aikuisortopedian kanssa.​