En isotretinoinbehandling kan också inledas när de korrekt genomförda övriga behandlingarna har visat sig vara ineffektiva eller om aknen har återkommit efter upprepad vederbörlig behandling.
Hudläkaren ansvarar för genomförandet och uppföljningen av isotretinoinbehandlingen. Under behandlingen genomgår patienten laboratorieundersökningar med tanke på eventuella biverkningar.
Vid vissa svårartade akneformer (acne fulminans, acne conglobata) är man, utöver isotretinoin, tvungen att använda läkemedel som tas via munnen. Behandlingen och uppföljingen av sådana patienter ska genomföras inom den specialiserade sjukvården och under övervakning av en hudläkare.