Hypokondroplasiassa esiintyy samanlaisia löydöksiä kuin akondroplasiassa, mutta ne ovat lievempiä. Pää on kooltaan normaalin ylärajoilla tai suuri, otsa voi olla leveä ja kupera. Seisoessa lannenotko voi olla korostunut ja kyynärnivelten lievä ojennusvaje on tavallista. Lievää länkisäärisyyttä esiintyy osalla potilaista. Toisin kuin akondroplasiaan hypokondroplasiaan voi osalla potilaista liittyä lievä henkisen kehityksen viive ja/tai epilepsia.
Liikunnallinen kehitys etenee normaalisti ja lihaksisto on yleensä hyvin kehittynyttä.
Hypokondroplasiaan liittyy harvoin lapsena niska-aukon (foramen magnum) ahtautta. Selkäytimen ahtauma (spinaalistenoosi) ja aivoselkäydinnesteen kiertohäiriöt ovat mahdollisia. Tämän vuoksi lapselle ohjelmoidaan diagnoosin jälkeen aivojen ja selkärangan magneettitutkimus.
Mahdollisten unenaikaisten hengityshäiriöiden toteamiseksi voidaan tarvita unitutkimuksia.
Anestesiatoimenpiteissä on huomioitava mahdollinen niska-aukon ahtauma.
Kasvuiässä hypokondroplasiapotilaiden kasvua ja päänympäryksen kehitystä seurataan akondroplasiapotilaiden kasvukäyrillä.
Aikuispituus naisilla on 128-151 cm ja miehillä 138-165 cm. Eliniän ennuste on normaali.