Operationsförberedelserna sker på överenskommen avdelning. I operationsförberedelserna ingår dusch, vid behov rakning av kroppsbehåring, möte med narkosläkaren samt premedicinering. Patienten är klar för operationen på ungefär en och en halv timme.
En anhörig eller en följeslagare kan vara med tills patienten förs till operationssalen. Till operationssalen förs patienten på en säng. I operationssalen påbörjas narkosförberedelserna och om det är möjligt insätts en epiduralkateter för smärtlindring efter operationen.
En lungtransplantation tar vanligen 10 - 12 timmar. Lungtransplantationen görs via en öppning i brösthålan med stöd av hjärt-lungmaskin. Vid en lungtransplantation förenas transplantatet med patientens luftrör, lungvener och lungartärer.
Patienten flyttas nersövd och i respirator från operationssalen för återhämtning till Hjärtkirurgiska intensivvårdsavdelningen där de anhöriga kan fråga om tillståndet.