Många ämnesomsättningssjukdomar har en genetisk grund, men epileptiska anfall orsakas av en störning i hjärnans ämnesomsättning. Den viktigaste metabola epilepsin som hittills identifierats är Glukostransportprotein typ 1-bristsyndrom (Glucose transporter type 1 deficiency syndrome [GLUT1-DS]), som är förknippad med en fördröjning i utvecklingen. Syndromet orsakas av en mutation i SLC2A1-genen.