MS-lääkehoitoa aloitettaessa tarvitaan melko hiljattain otettu magneettikuvaus, laboratoriokokeet ja lääkärin kannanotto niiden tuloksiin. MS-taudin lääkehoito suunnitellaan neurologin vastaanotolla sairauden vaikeusasteen, lääkevalmisteiden tehon ja mahdollisten haittavaikutusten sekä potilaan elämäntilanteen ja hänen oman näkemyksensä mukaan. Seurannassa lääkehoitoa voidaan tarpeen mukaan muuttaa tai tehostaa. MS-lääkehoidon aikana eri MS-lääkkeillä on erilainen verikokeiden ja kontrollikuvausten seurantasuunnitelma. Uuden lääkevalmisteen aloittamisen jälkeen lääkkeen toimivuutta ja tehoa voidaan arvioida aikaisintaan puolen vuoden kuluttua otetusta magneettikuvasta. Suunnitelmasta poiketen ylimääräisiä magneettikuvauksiakin saatetaan joskus tarvita kliinisen tilanteen niin vaatiessa. Hoidon vakiintuessa neurologin vastaanottokäynnillä käydään yleensä kerran vuodessa. Oireiden, toimintakyvyn ja neurologisen tutkimuksen sekä kontrollikuvauksen perusteella neurologi saa tilannekuvan hoidon tehosta. Neurologian poliklinikka ei ole ainoa MS-potilaan hoidosta vastaava yksikkö. Useimpiin MS-tautiin liittyviin ongelmiin (esim. kipuun, virtsarakko- ja suolisto-oireisiin, mieliala-ongelmiin) voi saada oireenmukaista lääkehoitoa läheltä omasta terveyskeskuksesta.